In Treasure Town regeren de weeskinderen Black en White de straten door geweld en terreur. Deze jongens zijn in alle opzichten het tegenovergestelde van elkaar: Black is de belichaming van alles dat fout is aan de stad, terwijl White een dromer is die amper meer in contact staat met de wereld om hem heen. Samen zijn ze niet te stoppen als ze het opnemen tegen kleine misdadigers, godsdienstige fanatici, en gewelddadige Yakuza. Maar wanneer een organisatie genaamd "Kiddy Kastle" de stad opnieuw wil opbouwen voor hun eigen doeleinden zullen de jongens er alles aan moeten doen om de ziel van hun stad te redden.